《果宝特攻3》讲述了菠萝吹雪偶然间穿越到了古代的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果，菠萝吹雪从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的英雄。菠萝吹雪开始修复时光机的旅程，竟然遇到了水果伙伴们的祖先，最后帮助他们打败了火龙果，并顺利回到现代。...

超星五灵侠接收到一个来自遥远外星的求救信号，迷糊要求大家在出发前加紧特训，提高实力。然而他们的训练方法错漏百出，小呆呆展示了深奥的功夫，并指导大家如何练功。在一番严厉的特训下，猪猪们学会了各自的功夫，并且在断桥试炼中通过考验，在最后时刻，搭上了猪扒号，带上各自的萌宠，一同前往全新的旅程。...